农民公寓的过户流程如下：
准备资料
房屋所有权证
契税证
双方的身份证明
户口本
村委同意过户的证明
过户确权审批表等。
签订过户合同
双方需签订过户合同，明确各自的权利义务和违约责任。
缴纳相关税费
需要缴纳契税、登记费、交易手续费等。
如果是划拨土地，需要补交土地出让金。
办理过户手续
双方需要在相关机构（如房管部门）办理过户手续。
提交测量绘图、填写申请等相关材料。
等待房管部门进行登记核查，符合法律规定后进行发证处理。
领取新的房屋所有权证
办理完过户手续后，双方将领取新的房屋所有权证。
需要注意的是，农民公寓一般属于小产权房，即未经过任何国家相关部门和环节审批建设在租用土地或非法侵占的土地上的房屋，不能取得国家承认的房屋所有权证，无法办理产权过户登记。因此，在考虑过户农民公寓时，务必确认其合法性，以避免因法律问题产生纠纷。
